Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Itga6Q61739 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Itga6Q61739 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Itga6Q61739 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms