Protein–RNA interactions for Protein: Q61468

Msln, Mesothelin, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MslnQ61468 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MslnQ61468 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MslnQ61468 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MslnQ61468 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MslnQ61468 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MslnQ61468 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MslnQ61468 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MslnQ61468 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms