Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn13Q3UW68 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn13Q3UW68 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Capn13Q3UW68 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn13Q3UW68 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms