Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Obox3Q3UT54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Obox3Q3UT54 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Obox3Q3UT54 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms