Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4clQ3TYX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn4clQ3TYX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lrrn4clQ3TYX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms