Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hddc2Q3SXD3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hddc2Q3SXD3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hddc2Q3SXD3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms