Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YLR283WYLR283W 945 nt8.75□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 MIX17YMR002W 471 nt8.75□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 MRPL22YNL177C 930 nt8.75□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 RFC4YOL094C 972 nt8.75□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 ADE13YLR359W 1449 nt8.74□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 YGR022CYGR022C 330 nt8.74□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SYN8YAL014C 768 nt8.74□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SFC1YJR095W 969 nt8.74□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 MRPS5YBR251W 924 nt8.74□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 TEA1YOR337W 2280 nt8.73□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 YDL129WYDL129W 876 nt8.73□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 ENB1YOL158C 1821 nt8.73□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 CAN1YEL063C 1773 nt8.73□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 UGX2YDL169C 672 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 TOD6YBL054W 1578 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 FLC2YAL053W 2352 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SUF16tG(GCC)C 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SUF20tG(GCC)F1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SUF23tG(GCC)J2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SUF17tG(GCC)O2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 QCR6YFR033C 444 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 SNO4YMR322C 714 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 HSP33YOR391C 714 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 HSP32YPL280W 714 nt8.72□□□□□ -1.01
DNF3Q12674 VID30YGL227W 2877 nt8.71□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 TUF1YOR187W 1314 nt8.71□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 PUF3YLL013C 2640 nt8.7□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YER137CYER137C 447 nt8.7□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 ERG3YLR056W 1098 nt8.7□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 PXL1YKR090W 2121 nt8.7□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 TDP1YBR223C 1635 nt8.69□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 SNF4YGL115W 969 nt8.69□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 CIN4YMR138W 576 nt8.69□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YNL019CYNL019C 855 nt8.68□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YNL033WYNL033W 855 nt8.68□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 AAD15YOL165C 432 nt8.68□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 ILV1YER086W 1731 nt8.67□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 LCB3YJL134W 1230 nt8.67□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 RPS3YNL178W 723 nt8.67□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 MRK1YDL079C 1506 nt8.67□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 CEM1YER061C 1329 nt8.67□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 PAC2YER007W 1557 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 COX20YDR231C 618 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 CBP4YGR174C 513 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 OPI11YPR044C 354 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YMR155WYMR155W 1644 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YLL066CYLL066C 3618 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 YLL067CYLL067C 3618 nt8.66□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 MET30YIL046W 1923 nt8.65□□□□□ -1.02
DNF3Q12674 KNH1YDL049C 807 nt8.65□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt8.65□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 ATG12YBR217W 561 nt8.65□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 LST8YNL006W 912 nt8.64□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YNR042WYNR042W 429 nt8.64□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 SNT309YPR101W 528 nt8.64□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 LDB16YCL005W 771 nt8.64□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 TPO3YPR156C 1869 nt8.64□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 COR1YBL045C 1374 nt8.63□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 AIM2YAL049C 741 nt8.63□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YLR112WYLR112W 420 nt8.63□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 IME2YJL106W 1938 nt8.63□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 ARP2YDL029W 1176 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 MRPL28YDR462W 444 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YFL064CYFL064C 525 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 DFR1YOR236W 636 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YPR202WYPR202W 717 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 HSM3YBR272C 1443 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 RIX7YLL034C 2514 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 PRB1YEL060C 1908 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 EDE1YBL047C 4146 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 DCN1YLR128W 810 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 HCR1YLR192C 798 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YLR194CYLR194C 765 nt8.62□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YCR041WYCR041W 333 nt8.61□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.61□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 YJR015WYJR015W 1533 nt8.6□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 ITR1YDR497C 1755 nt8.6□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 MHP1YJL042W 4197 nt8.59□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 ECM31YBR176W 939 nt8.59□□□□□ -1.03
DNF3Q12674 PYK2YOR347C 1521 nt8.59□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 SEC24YIL109C 2781 nt8.58□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt8.58□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 MTR3YGR158C 753 nt8.58□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 YMR253CYMR253C 1245 nt8.58□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 CCC2YDR270W 3015 nt8.58□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 AFG1YEL052W 1530 nt8.57□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 YOR012WYOR012W 414 nt8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 97.8 ms