Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssrp1Q08943 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssrp1Q08943 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssrp1Q08943 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms