Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hspg2Q05793 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hspg2Q05793 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hspg2Q05793 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hspg2Q05793 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms