Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Epha4Q03137 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epha4Q03137 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epha4Q03137 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epha4Q03137 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms