Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VegfcP97953 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfcP97953 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfcP97953 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfcP97953 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfcP97953 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfcP97953 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfcP97953 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfcP97953 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfcP97953 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfcP97953 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfcP97953 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfcP97953 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfcP97953 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfcP97953 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VegfcP97953 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms