Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Atp1b3P97370 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atp1b3P97370 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atp1b3P97370 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b3P97370 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b3P97370 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 201.2 ms