Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gp1bbP56400 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gp1bbP56400 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gp1bbP56400 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gp1bbP56400 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms