Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc11P31313 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc11P31313 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc11P31313 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxc11P31313 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxc11P31313 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms