Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp3P28862 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Mmp3P28862 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp3P28862 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp3P28862 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms