Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxd12P23812 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd12P23812 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd12P23812 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd12P23812 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms