Protein–RNA interactions for Protein: P21576

VPS1, Vacuolar protein sorting-associated protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS1P21576 MEU1YLR017W 1014 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS1P21576 KSH1YNL024C-A 219 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS1P21576 ECM38YLR299W 1983 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS1P21576 CCC2YDR270W 3015 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS1P21576 TOS2YGR221C 1869 nt7.25□□□□□ -1.25
VPS1P21576 MDE1YJR024C 735 nt7.24□□□□□ -1.25
VPS1P21576 YKR032WYKR032W 315 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS1P21576 DRE2YKR071C 1047 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS1P21576 SMK1YPR054W 1167 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS1P21576 UIP5YKR044W 1332 nt7.23□□□□□ -1.25
VPS1P21576 LDB16YCL005W 771 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS1P21576 BDF2YDL070W 1917 nt7.21□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YMR279CYMR279C 1623 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 UTR2YEL040W 1404 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 GAL83YER027C 1254 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YLR123CYLR123C 330 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 GLC8YMR311C 690 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 COX5AYNL052W 462 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 ARG81YML099C 2643 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 PRP2YNR011C 2631 nt7.2□□□□□ -1.26
VPS1P21576 MSP1YGR028W 1089 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS1P21576 RPP1YHR062C 882 nt7.19□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YPR196WYPR196W 1413 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 ZWF1YNL241C 1518 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 SDH4YDR178W 546 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YLR463CYLR463C 552 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YML018CYML018C 1182 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 RUF23RUF23 254 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 ECM31YBR176W 939 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 ERG12YMR208W 1332 nt7.18□□□□□ -1.26
VPS1P21576 AMD2YDR242W 1650 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.17□□□□□ -1.26
VPS1P21576 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS1P21576 AIM24YJR080C 1185 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YLR184WYLR184W 348 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YMR122CYMR122C 375 nt7.16□□□□□ -1.26
VPS1P21576 YHL018WYHL018W 363 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 TDH2YJR009C 999 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 VPS24YKL041W 675 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 MEH1YKR007W 555 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 RRN10YBL025W 438 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 SES1YDR023W 1389 nt7.15□□□□□ -1.26
VPS1P21576 RRP9YPR137W 1722 nt7.15□□□□□ -1.27
VPS1P21576 ECM30YLR436C 3825 nt7.15□□□□□ -1.27
VPS1P21576 BUG1YDL099W 1026 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS1P21576 IMD1YAR073W 1212 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS1P21576 FPR3YML074C 1236 nt7.14□□□□□ -1.27
VPS1P21576 PPT1YGR123C 1542 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS1P21576 YPL136WYPL136W 369 nt7.13□□□□□ -1.27
VPS1P21576 SGE1YPR198W 1632 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS1P21576 TMT1YER175C 900 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS1P21576 SUR7YML052W 909 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS1P21576 COQ3YOL096C 939 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS1P21576 ADE17YMR120C 1779 nt7.12□□□□□ -1.27
VPS1P21576 ARP3YJR065C 1350 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS1P21576 POR2YIL114C 846 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS1P21576 YMR295CYMR295C 594 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS1P21576 RKI1YOR095C 777 nt7.11□□□□□ -1.27
VPS1P21576 HRQ1YDR291W 3234 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS1P21576 RVB2YPL235W 1416 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS1P21576 EMP65YER140W 1671 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS1P21576 SKY1YMR216C 2229 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS1P21576 CIR2YOR356W 1896 nt7.1□□□□□ -1.27
VPS1P21576 RAD59YDL059C 717 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS1P21576 TFG2YGR005C 1203 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS1P21576 PSR2YLR019W 1194 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS1P21576 MLS1YNL117W 1665 nt7.09□□□□□ -1.27
VPS1P21576 PEX3YDR329C 1326 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS1P21576 YIR042CYIR042C 711 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS1P21576 QCR8YJL166W 285 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS1P21576 YTP1YNL237W 1380 nt7.08□□□□□ -1.28
VPS1P21576 RSP5YER125W 2430 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS1P21576 RPS3YNL178W 723 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS1P21576 KTR1YOR099W 1182 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS1P21576 CLN1YMR199W 1641 nt7.07□□□□□ -1.28
VPS1P21576 MCH1YDL054C 1461 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS1P21576 HVG1YER039C 750 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS1P21576 CTF8YHR191C 402 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS1P21576 LCB3YJL134W 1230 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS1P21576 CRP1YHR146W 1398 nt7.06□□□□□ -1.28
VPS1P21576 COA1YIL157C 594 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS1P21576 YJR154WYJR154W 1041 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS1P21576 IES2YNL215W 963 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS1P21576 DSF1YEL070W 1509 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS1P21576 YNR073CYNR073C 1509 nt7.05□□□□□ -1.28
VPS1P21576 PGM1YKL127W 1713 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS1P21576 YJR084WYJR084W 1272 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS1P21576 MRPL10YNL284C 969 nt7.04□□□□□ -1.28
VPS1P21576 PYC2YBR218C 3543 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS1P21576 ILV1YER086W 1731 nt7.03□□□□□ -1.28
VPS1P21576 FYV1YDR024W 486 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS1P21576 NMD5YJR132W 3147 nt7.02□□□□□ -1.29
VPS1P21576 TPK1YJL164C 1194 nt7.01□□□□□ -1.29
VPS1P21576 PRY3YJL078C 2646 nt7□□□□□ -1.29
VPS1P21576 POX1YGL205W 2247 nt7□□□□□ -1.29
VPS1P21576 ECM14YHR132C 1293 nt7□□□□□ -1.29
VPS1P21576 HMS2YJR147W 1077 nt7□□□□□ -1.29
VPS1P21576 AIM33YML087C 939 nt7□□□□□ -1.29
VPS1P21576 FSF1YOR271C 984 nt7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.4 ms