Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NefhP19246 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NefhP19246 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NefhP19246 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NefhP19246 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NefhP19246 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NefhP19246 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NefhP19246 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NefhP19246 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NefhP19246 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NefhP19246 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NefhP19246 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NefhP19246 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NefhP19246 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NefhP19246 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NefhP19246 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefhP19246 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NefhP19246 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefhP19246 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefhP19246 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefhP19246 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NefhP19246 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NefhP19246 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefhP19246 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefhP19246 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefhP19246 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefhP19246 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NefhP19246 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefhP19246 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefhP19246 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefhP19246 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NefhP19246 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefhP19246 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefhP19246 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefhP19246 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NefhP19246 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NefhP19246 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefhP19246 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NefhP19246 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefhP19246 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefhP19246 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NefhP19246 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefhP19246 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefhP19246 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NefhP19246 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefhP19246 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefhP19246 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefhP19246 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefhP19246 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NefhP19246 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefhP19246 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefhP19246 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefhP19246 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NefhP19246 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NefhP19246 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefhP19246 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefhP19246 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NefhP19246 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.3 ms