Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tph1P17532 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tph1P17532 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tph1P17532 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tph1P17532 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tph1P17532 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tph1P17532 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tph1P17532 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tph1P17532 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tph1P17532 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms