Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spi1P17433 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spi1P17433 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spi1P17433 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Spi1P17433 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Spi1P17433 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms