Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SrgnP13609 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrgnP13609 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrgnP13609 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SrgnP13609 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SrgnP13609 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrgnP13609 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrgnP13609 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SrgnP13609 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrgnP13609 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SrgnP13609 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrgnP13609 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrgnP13609 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrgnP13609 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms