Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrm1P12657 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrm1P12657 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrm1P12657 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chrm1P12657 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms