Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd4P10628 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hoxd4P10628 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms