Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Syngr1O55100 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syngr1O55100 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr1O55100 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syngr1O55100 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms