Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cavin1O54724 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cavin1O54724 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cavin1O54724 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cavin1O54724 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cavin1O54724 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms