Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U3

2210016F16Rik, MCG6895, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210016F16RikG3X8U3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210016F16RikG3X8U3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2210016F16RikG3X8U3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
2210016F16RikG3X8U3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
2210016F16RikG3X8U3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms