Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5830473C10RikF8VQ07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
5830473C10RikF8VQ07 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
5830473C10RikF8VQ07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms