Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rfx7F8VPJ6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rfx7F8VPJ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rfx7F8VPJ6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rfx7F8VPJ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rfx7F8VPJ6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rfx7F8VPJ6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Rfx7F8VPJ6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rfx7F8VPJ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Rfx7F8VPJ6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rfx7F8VPJ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms