Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lrp3E9Q1T6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrp3E9Q1T6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrp3E9Q1T6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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