Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trappc8E9PWG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trappc8E9PWG2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Trappc8E9PWG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Trappc8E9PWG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trappc8E9PWG2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trappc8E9PWG2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms