Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pramel3A2AHA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pramel3A2AHA7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Pramel3A2AHA7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pramel3A2AHA7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms