Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb3P09026 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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