Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc166S4R181 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc166S4R181 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc166S4R181 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.2 ms