Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trip6Q9Z1Y4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Trip6Q9Z1Y4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trip6Q9Z1Y4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trip6Q9Z1Y4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trip6Q9Z1Y4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms