Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nr1h3Q9Z0Y9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1h3Q9Z0Y9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1h3Q9Z0Y9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms