Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sh2d3cQ9QZS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms