Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc1Q9QZF2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc1Q9QZF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc1Q9QZF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms