Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc2Q9QWH1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc2Q9QWH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc2Q9QWH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phc2Q9QWH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phc2Q9QWH1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms