Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Akip1Q9JJR5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Akip1Q9JJR5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Akip1Q9JJR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms