Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHU2

Palmd, Palmdelphin, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalmdQ9JHU2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PalmdQ9JHU2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PalmdQ9JHU2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PalmdQ9JHU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PalmdQ9JHU2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PalmdQ9JHU2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PalmdQ9JHU2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PalmdQ9JHU2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PalmdQ9JHU2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms