Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtaQ9JHK4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RabggtaQ9JHK4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RabggtaQ9JHK4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RabggtaQ9JHK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms