Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim54Q9ERP3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim54Q9ERP3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim54Q9ERP3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim54Q9ERP3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms