Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnn1Q9EQR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnn1Q9EQR3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnn1Q9EQR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Kcnn1Q9EQR3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnn1Q9EQR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms