Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Polr2dQ9D7M8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr2dQ9D7M8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr2dQ9D7M8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Polr2dQ9D7M8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms