Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4f1Q9D5Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4f1Q9D5Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms