Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UvssaQ9D479 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
UvssaQ9D479 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
UvssaQ9D479 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UvssaQ9D479 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UvssaQ9D479 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UvssaQ9D479 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UvssaQ9D479 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UvssaQ9D479 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UvssaQ9D479 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms