Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sppl3Q9CUS9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sppl3Q9CUS9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sppl3Q9CUS9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sppl3Q9CUS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sppl3Q9CUS9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms