Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4930553M12RikQ9CUH1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4930553M12RikQ9CUH1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930553M12RikQ9CUH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms