Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV1

Pam16, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM16, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pam16Q9CQV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pam16Q9CQV1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pam16Q9CQV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pam16Q9CQV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pam16Q9CQV1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms