Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hdac9Q99N13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hdac9Q99N13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hdac9Q99N13 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hdac9Q99N13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hdac9Q99N13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms